Transition=
GG      0.9990
GE      0.0010
ER      0.9965
ES	0.0030
ES1	0.0005
RS      0.0040
RR      0.9920
MM      0.9704
MI      0.0233
MD      0.0063
II      0.0235
IM      0.9765
DD      0.0059
DM      0.9941
TransitionMI=
A       A       0.0021
A       C       0.5495
A       G       0.3340
A       T       0.1144
C       A       0.0972
C       C       0.0011
C       G       0.5521
C       T       0.3496
G       A       0.3516
G       C       0.0736
G       G       0.0005
G       T       0.5744
T       A       0.6070
T       C       0.3188
T       G       0.0712
T       T       0.0031
TransitionII=
A       A       0.5210
A       C       0.4068
A       G       0.0722
A       T       0.0000
C       A       0.0001
C       C       0.4833
C       G       0.4048
C       T       0.1119
G       A       0.0892
G       C       0.0000
G       G       0.4796
G       T       0.4311
T       A       0.4449
T       C       0.0739
T       G       0.0006
T       T       0.4806
PI=
S	0.000001	
E	0.000001
R	0.077
S_1	0.000001
E_1	0.000001
M1	0.077
M2	0.077
M3	0.077
M4	0.077
M5	0.077
M6	0.077
M1_1	0.077
M2_1	0.077
M3_1	0.077
M4_1	0.077
M5_1	0.077
M6_1	0.077
I1	0.000001
I2	0.000001
I3	0.000001
I4	0.000001
I5	0.000001
I6	0.000001
I1_1	0.000001
I2_1	0.000001
I3_1	0.000001
I4_1	0.000001
I5_1	0.000001
I6_1	0.000001