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# Definitions
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FOLDER_ROOT=..
FOLDER_BUILD=../build

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# Modules
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MODULES=affine_penalties \
        affine2p_penalties \
        cigar \
        score_matrix
        
SRCS=$(addsuffix .c, $(MODULES))
OBJS=$(addprefix $(FOLDER_BUILD)/, $(SRCS:.c=.o))

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# Rules
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all: $(OBJS)

# General building rule
$(FOLDER_BUILD)/%.o : %.c
	$(CC) $(CC_FLAGS) -I$(FOLDER_ROOT) -c $< -o $@